口腔溃疡也被认为与遗传、内分泌失调、自身免疫力降低等因素有关，如女性患者月经来潮前后而诱发此病，更年期妇女则病例有升高现象，但怀孕期妇女则发病率较低，这些现象都显示溃疡的发生受内分泌变化影响。此外，消化不良、便秘、微量元素缺少等都诱发口腔溃疡。口腔溃疡的病因较复杂，临床治疗要根据不同的诱因，针对性地治疗，才能获得好的疗效。如：解除精神紧张的压力，镇静，安眠，戒烟、酒等；有消化道疾患的要治疗相应的疾病，增加机体的抵抗力，对于溃疡局部，可采用局部止痛、消炎，促进愈合的药物。许洁医生说，
口腔溃疡在很大程度上与个人身体素质有关，要想完全避免其发生可能性不大，但尽量避免诱发因素，仍可降低发生率。用口腔溃疡贴膜、吃西瓜霜含片，可是有些人的口腔溃疡怎么治都治不好，如果看中国中医科学院望京医院内科王泽民主任的门诊，他多半儿会建议患者吃点通便的药。 口腔溃疡多数发生在20岁至50岁之间。发病时多伴有便秘、口臭等现象。一般人认为，口腔溃疡会在7至10天内自行痊愈。问题是许多病人的病情往往显得反反复复，时好时坏，影响饮食和起居，令人困扰。中医认为，要改善复发性口腔溃疡应注意排便通畅、睡眠充足。自然疗法治疗师认为，多吃新鲜水果和蔬菜可以清理肠胃，同时由于口腔溃疡也可能是缺乏维生素B2引起，可多吃蔬菜和小麦胚?，并补充维生素B2和锌。
口腔溃疡也被认为是身体变弱的信号，所以患者在治疗的过程中，要加强身体健康，改善体质。